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mercredi, février 27 2008

 
 

R2spec v1.2

Par pingou (Le blog de pingou) le mercredi, février 27 2008, 15:09

New release of R2spec

Nouvelle version de R2spec

French version

Suite aux remarques faites par torbjorn sur les résultats de ce programme je l'ai adapté pour éviter de nouvelles erreurs..

Merci torbjorn ;-)

Les nouvelles foncitonnalités sont donc:

  • Retirer ce qui suit un "-" si le numéro de version en contient un
  • Correction d'une erreur de frappe en standart output
  • Quand le programme est lancé avec une url en argument vérifier la présence de la source dans le dossier courant et ne la télécharger que si elle n'est pas là.

Je vous renvois à mon premier billet pour de plus amples informations sur ce programme.

R2spec_1.2.py

English version

Based on the remarks from torbjorn, there are the corrections made on the script so that it returns less errors...

Thank you torbjorn ;-) (once agian ;-) )

The new feature are then:

  • Remove "-\d" if the version contains one
  • Correct output typo
  • From an url, check if the source are present in the working directory, download only if not...

You can get more information on this soft on my first post.

R2spec_1.2.py

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

mardi, février 26 2008

 
 

R2spec v1.1

Par pingou (Le blog de pingou) le mardi, février 26 2008, 12:20

New release of R2spec

Nouvelle version de R2spec

French version

J'ai pris ce matin le temps de mettre à jour mon programme python pour lui mettre les quelques fonctionnalitées que j'avais en tête...

Les nouvelles foncitonnalités sont donc:

  • Le dossier crée lors de la décompression des sources est supprimé
  • Les sources peuvent être dans le dossier courant ou un sous dossier quelquonque
  • Le mode d'emploi est affiché si aucun argument n'est donné
  • Le dossier 'tmp' crée pour décompressé les archives, est supprimé s'il est vide

Je vous renvois à mon premier billet pour de plus amples informations sur ce programme.

R2spec_1.1.py

English version

I took the time this morning to improve my program R2spec in order to give it the feature I was thinking about...

The new feature are then:

  • Removes the folder create by the decompressing the sources
  • Works if the sources are in the current directory or a subdirectory
  • Returns the usage if no argument are given
  • Removes the 'tmp' directory created for decompressing the source if they are empty at the end

You can get more information on this soft on my first post.

R2spec_1.1.py

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

mercredi, février 13 2008

 
 

R2spec

Par pingou (Le blog de pingou) le mercredi, février 13 2008, 19:05

A small python script to generate specfile for R libraries

Un petit script en python pour créer des spec pour les packages R

French Version

Pour apprendre le python je me suis amusé à créer l'équivalent du fameux cpan2spec pour les bibliothèques R.

Je remet un petit lien sur le site du Projet R pour ceux qui connaissent mal ce langage :)

Et pour tester mon script je vous l'ai mis en ligne sur R2spec

Enjoy !


English version

In order to learn python I have written a small script based on the idea of cpan2spec for the R libraries...

More information about R can be found on the R Project.

If you want to test this script feel free to try R2spec

Let me know what you think about it :)

Enjoy !

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

mardi, octobre 16 2007

 
 

R 2.6 et Bioconductor 2.1

Par pingou (Le blog de pingou) le mardi, octobre 16 2007, 14:47

R 2.6 is out and Bioconductor 2.1 to

R 2.6 est sortie et Bioconductor 2.1 aussi

French version

R  2.6 est sortie !!

J'ai beau être en retard sur sa sortie (le 3 octobre), je voulais faire un petit mot pour dire que la dernière version de R est sortie et est maintenant disponible sous Fedora Core 6, Fedora 7 et la version encore en développement de Fedora la Fedora 8.

R 2.6 inclu quelques nouveautées:

  • En tant que packagers de bibliothèques R je suis intéressé par l'addition d'une copie de la license utilisé par la bibliothèque aux sources de celle-ci.
  • À noté par contre que comme chaque changement de version certaines fonction deviennet obsolètes et que par conséquent il faudras sans doute revoir certaine commande dans vos scripts...

Le mail d'annonce de la sortie de R 2.6 vous en apprendras plus sur les nouveautés de cette version.

Bioconductor 2.1 est sortie !!

Bioconductor est un dépôt de bibliothèques R orientées analyse bioinformatique et puces à ADN, on y retrouve les bibliothèque telle que Affy ou Biobase qui sont très utilisé dans l'analyse statistique de ces dites puces à ADN. Dans cette nouvelle version de Bioconductor compilé pour R 2.6 vous trouverez un certain nombres de nouveautées dans les bibliothèque précédement proposées mais aussi un certain nombre de nouvelles.

Le mail de publication de la nouvelle version de bioconductor vous en apprendras plus sur ces changements et les nouveautées.



English version

R  2.6 is out !!

Even late on the event, I wanted to do a small post about the new release of R2.6, thanks to the work done by Spot R 2.6 is now available for Fedora Core 6, Fedora 7 and the rawhide version Fedora 8.

R 2.6 includes some new things:

  • As package of R libraries I am interested in the fact that now R libraries should include a copy of the license under which they are published.
  • You should know that as with all new release some commands are deprecated, so some scripts might have to be revised.

The annoucement should learn you more about these changes.

Bioconductor 2.1 is out !!

Some days later the new version of Bioconductor has been released to. Bioconductor is a R repository for libraries oriented on bioinformatic and microarrays. You will find there some libraries like Affy and Biobase that are really well used for the statistical analysis of microarrays. This new release done for R 2.6 includes quite some change in the previous libraries but also put some new libraries as stable.

The annoucement should give you more information about these changes.

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

dimanche, juillet 15 2007

 
 

Quelques nouvelles Fedora

Par pingou (Le blog de pingou) le dimanche, juillet 15 2007, 22:37

Some news from and Fedora

Quelques nouvelles de pingou et Fedora

French version

Voila je n'ai pas été bien bavard ces derniers temps, alors je me décide à vous donner quelques nouvelles...

Mon silence ne signifiant pas l'absence de nouveauté sous Fedora:

1) Suite à la demande de revue de quelques (9) RPMs pour des bibliothèques R. Le guide de packaging pour les bibliothèques R pour Fedora ont été publiée.

2) Suite à la parution des ce guide de packaging, ma première, puis seconde bibliothèque R ont été approuvée.

3) Ce week-end je suis allé me promener aux Rencontres Mondiales du Logiciel Libre, après m'être promener dans Amiens pour trouver le lieux (très jolie ville au passage). J'en retrouvé quelques contacts connus de l'IP de Paris et des 24h de l'informatique de Maubeuge. J'ai aussi rencontrer un deboggueur OOo, un contributeur de Compiz, et bien sur quelques utilisateurs de Fedora présent à ce salon...

J'y ai ensuite retrouvé quelques amis, RemiFedora, sereinity, littlecharly...

Voila c'est quelques lignes pour vous tenir au courant de mes actualités Fedora... Mais il me reste quelques todo:

  • Comprendre comment marche cvs et intégré mes RPM dans le FPC ;-)
  • Finir de faire approuver mes RPMs :-)
  • Finir le livret de présentation de Fedora pour les événements :-)

English version

Well I have not been writing a lot recently, so there is a little update on what is new for me on Fedora

1) Once I put some (presently 9) packages for review on the bugzilla. The packaging guidelines for R have been published.

2) Once these guidelines have been published my first and then second package for R have been approved.

3) I went to the Libre Sofware Meeting in Amiens this week end. It has been a very nice place to meet some Fedora user, and other contributor ie from Open Office.

I also met some friend from Fedora-fr, RemiFedora, sereinity and littlecharly.

That was just few words to keep you in touch with what I am working on actually... But well.. I still have some things on my todo list :-p :

  • Understand how works cvs to put my package on... ;-)
  • Finish to have my packages approved :-)
  • Finish the introduction to Fedora booklet for the French Fedora events. :-)

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

Quelques nouvelles Fedora

Par pingou (Le blog de pingou) le dimanche, juillet 15 2007, 22:37

Some news from and Fedora

Quelques nouvelles de pingou et Fedora

French version

Voila je n'ai pas été bien bavard ces derniers temps, alors je me décide à vous donner quelques nouvelles...

Mon silence ne signifiant pas l'absence de nouveauté sous Fedora:

1) Suite à la demande de revue de quelques (9) RPMs pour des bibliothèques R. Le guide de packaging pour les bibliothèques R pour Fedora ont été publiée.

2) Suite à la parution des ce guide de packaging, ma première, puis seconde bibliothèque R ont été approuvée.

3) Ce week-end je suis allé me promener aux Rencontres Mondiales du Logiciel Libre, après m'être promener dans Amiens pour trouver le lieux (très jolie ville au passage). J'en retrouvé quelques contacts connus de l'IP de Paris et des 24h de l'informatique de Maubeuge. J'ai aussi rencontrer un deboggueur OOo, un contributeur de Compiz, et bien sur quelques utilisateurs de Fedora présent à ce salon...

J'y ai ensuite retrouvé quelques amis, RemiFedora, sereinity, littlecharly...

Voila c'est quelques lignes pour vous tenir au courant de mes actualités Fedora... Mais il me reste quelques todo:

  • Comprendre comment marche cvs et intégré mes RPM dans le FPC ;-)
  • Finir de faire approuver mes RPMs :-)
  • Finir le livret de présentation de Fedora pour les événements :-)

English version

Well I have not been writing a lot recently, so there is a little update on what is new for me on Fedora

1) Once I put some (presently 9) packages for review on the bugzilla. The packaging guidelines for R have been published.

2) Once these guidelines have been published my first and then second package for R have been approved.

3) I went to the Libre Sofware Meeting in Amiens this week end. It has been a very nice place to meet some Fedora user, and other contributor ie from Open Office.

I also met some friend from Fedora-fr, RemiFedora, sereinity and littlecharly.

That was just few words to keep you in touch with what I am working on actually... But well.. I still have some things on my todo list :-p :

  • Understand how works cvs to put my package on... ;-)
  • Finish to have my packages approved :-)
  • Finish the introduction to Fedora booklet for the French Fedora events. :-)

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

Quelques nouvelles Fedora

Par pingou (Le blog de pingou) le dimanche, juillet 15 2007, 22:37

Some news from and Fedora

Quelques nouvelles de pingou et Fedora

French version

Voila je n'ai pas été bien bavard ces derniers temps, alors je me décide à vous donner quelques nouvelles...

Mon silence ne signifiant pas l'absence de nouveauté sous Fedora:

1) Suite à la demande de revue de quelques (9) RPMs pour des bibliothèques R. Le guide de packaging pour les bibliothèques R pour Fedora ont été publiée.

2) Suite à la parution des ce guide de packaging, ma première, puis seconde bibliothèque R ont été approuvée.

3) Ce week-end je suis allé me promener aux Rencontres Mondiales du Logiciel Libre, après m'être promener dans Amiens pour trouver le lieux (très jolie ville au passage). J'en retrouvé quelques contacts connus de l'IP de Paris et des 24h de l'informatique de Maubeuge. J'ai aussi rencontrer un deboggueur OOo, un contributeur de Compiz, et bien sur quelques utilisateurs de Fedora présent à ce salon...

J'y ai ensuite retrouvé quelques amis, RemiFedora, sereinity, littlecharly...

Voila c'est quelques lignes pour vous tenir au courant de mes actualités Fedora... Mais il me reste quelques todo:

  • Comprendre comment marche cvs et intégré mes RPM dans le FPC ;-)
  • Finir de faire approuver mes RPMs :-)
  • Finir le livret de présentation de Fedora pour les événements :-)

English version

Well I have not been writing a lot recently, so there is a little update on what is new for me on Fedora

1) Once I put some (presently 9) packages for review on the bugzilla. The packaging guidelines for R have been published.

2) Once these guidelines have been published my first and then second package for R have been approved.

3) I went to the Libre Sofware Meeting in Amiens this week end. It has been a very nice place to meet some Fedora user, and other contributor ie from Open Office.

I also met some friend from Fedora-fr, RemiFedora, sereinity and littlecharly.

That was just few words to keep you in touch with what I am working on actually... But well.. I still have some things on my todo list :-p :

  • Understand how works cvs to put my package on... ;-)
  • Finish to have my packages approved :-)
  • Finish the introduction to Fedora booklet for the French Fedora events. :-)

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

jeudi, juin 14 2007

 
 

Une journée au boulot..

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, juin 14 2007, 19:14

A day at work...

Une journée productive

French version

Aujourd'hui fut une bonne journée, en effet, journée de boulot... résultat :

  • JabRef passé à mock et corrigé en conséquence
  • SteGUI proposé sur le bugzilla pour review Bug 244171

Je rappel juste que mon boulot n'est pas de faire des RPMs :-D

Bon je vais pas non plus ne rien faire de ma soirée alors

Voila après j'ai trouvé plein de logiciels de bioinformatique à essayer :-p

English version

Today has been a good working day... at work I managed to do :

  • JabRef has been through mock and has corrected in consequence (I know I should have done it before :-/ )
  • SteGUI review request on the bugzilla Bug 244171

Just for memory, my job is not to compile RPMs :-D

But as I do not want to do nothing this evening I submit for review on the bugzilla :

And to conclude I found some nice bioinformatic program to compile in the coming days :-D

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

Une journée au boulot..

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, juin 14 2007, 19:14

A day at work...

Une journée productive

French version

Aujourd'hui fut une bonne journée, en effet, journée de boulot... résultat :

  • JabRef passé à mock et corrigé en conséquence
  • SteGUI proposé sur le bugzilla pour review Bug 244171

Je rappel juste que mon boulot n'est pas de faire des RPMs :-D

Bon je vais pas non plus ne rien faire de ma soirée alors

Voila après j'ai trouvé plein de logiciels de bioinformatique à essayer :-p

English version

Today has been a good working day... at work I managed to do :

  • JabRef has been through mock and has corrected in consequence (I know I should have done it before :-/ )
  • SteGUI review request on the bugzilla Bug 244171

Just for memory, my job is not to compile RPMs :-D

But as I do not want to do nothing this evening I submit for review on the bugzilla :

And to conclude I found some nice bioinformatic program to compile in the coming days :-D

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

Une journée au boulot..

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, juin 14 2007, 19:14

A day at work...

Une journée productive

French version

Aujourd'hui fut une bonne journée, en effet, journée de boulot... résultat :

  • JabRef passé à mock et corrigé en conséquence
  • SteGUI proposé sur le bugzilla pour review Bug 244171

Je rappel juste que mon boulot n'est pas de faire des RPMs :-D

Bon je vais pas non plus ne rien faire de ma soirée alors

Voila après j'ai trouvé plein de logiciels de bioinformatique à essayer :-p

English version

Today has been a good working day... at work I managed to do :

  • JabRef has been through mock and has corrected in consequence (I know I should have done it before :-/ )
  • SteGUI review request on the bugzilla Bug 244171

Just for memory, my job is not to compile RPMs :-D

But as I do not want to do nothing this evening I submit for review on the bugzilla :

And to conclude I found some nice bioinformatic program to compile in the coming days :-D

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

mercredi, juin 13 2007

 
 

RPM R-pls

Par pingou (Le blog de pingou) le mercredi, juin 13 2007, 20:53

R-pls - Multivariate regression by PLSR and PCR

R-pls-Régression multivariée par PLSR et PCR

French version

R-pls

Régression multivariée par la technique des moindres carrés et l'analyse en composants principales

English version

R-pls

Multivariate regression by partial least squares regression (PLSR) and principal component regression (PCR)

Official website

R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm

R-pls-2.0-2.fc6.src.rpm

R-pls.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-pls/R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

RPM R-pls

Par pingou (Le blog de pingou) le mercredi, juin 13 2007, 20:53

rpm.pngR-pls - Multivariate regression by PLSR and PCR

R-pls-Régression multivariée par PLSR et PCR

French version

R-pls

Régression multivariée par la technique des moindres carrés et l'analyse en composants principales

English version

R-pls

Multivariate regression by partial least squares regression (PLSR) and principal component regression (PCR)

Official website

R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm

R-pls-2.0-2.fc6.src.rpm

R-pls.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-pls/R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

RPM R-pls

Par pingou (Le blog de pingou) le mercredi, juin 13 2007, 20:53

rpm.pngR-pls - Multivariate regression by PLSR and PCR

R-pls-Régression multivariée par PLSR et PCR

French version

R-pls

Régression multivariée par la technique des moindres carrés et l'analyse en composants principales

English version

R-pls

Multivariate regression by partial least squares regression (PLSR) and principal component regression (PCR)

Official website

R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm

R-pls-2.0-2.fc6.src.rpm

R-pls.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-pls/R-pls-2.0-2.fc6.noarch.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

jeudi, mai 24 2007

 
 

R-Dyndoc-1.14.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:14

R-Dyndoc-1.14.0 - Functions for dynamic documents

R-Dyndoc-1.14.0 - Fonctions pour des documents dynamique

R-Dyndoc-1.14.0

Ensemble de fonctions pour crée une interface avec des documents dynamique et des vignettes

English version R-Dyndoc-1.14.0

A set of functions to create and interact with dynamic documents and vignettes.

Official website

R-DynDoc-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm

R-DynDoc-1.14.0-1.fc7.src.rpm

R-DynDoc.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-Dyndoc/R-DynDoc-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm '

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-Dyndoc-1.14.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:14

rpm.pngR-Dyndoc-1.14.0 - Functions for dynamic documents

R-Dyndoc-1.14.0 - Fonctions pour des documents dynamique

R-Dyndoc-1.14.0

Ensemble de fonctions pour crée une interface avec des documents dynamique et des vignettes

English version R-Dyndoc-1.14.0

A set of functions to create and interact with dynamic documents and vignettes.

Official website

R-DynDoc-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm

R-DynDoc-1.14.0-1.fc7.src.rpm

R-DynDoc.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-Dyndoc/R-DynDoc-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm '

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-tkWidgets-1.14.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:06

R-tkWidgets-1.14.0 - Widgets to provide user interfaces

R-tkWidgets-1.14.0 - Widgets pour une interface utilisateurs

French version

R-tkWidgets-1.14.0

Widgets pour une interface utilisateur. tcltk est nécessaire pour widget

English version

R-tkWidgets-1.14.0

Widgets to provide user interfaces. tcltk should have been installed for the widgets to run.

Official website

R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm

R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.src.rpm

R-tkWidgets.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-tkWidgets/R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.src.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-tkWidgets-1.14.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:06

rpm.pngR-tkWidgets-1.14.0 - Widgets to provide user interfaces

R-tkWidgets-1.14.0 - Widgets pour une interface utilisateurs

French version

R-tkWidgets-1.14.0

Widgets pour une interface utilisateur. tcltk est nécessaire pour widget

English version

R-tkWidgets-1.14.0

Widgets to provide user interfaces. tcltk should have been installed for the widgets to run.

Official website

R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.noarch.rpm

R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.src.rpm

R-tkWidgets.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-tkWidgets/R-tkWidgets-1.14.0-2.fc6.src.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-widgetTools-1.12.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:01

rpm.pngR-widgetTools-1.12.0-2 - Tools to support the construction of tcltk widgets

R-widgetTools-1.12.0-2 - Outils de support de construction de tcltk widgets

French version

R-widgetTools-1.12.0-2

Ce paquet contiens des outils de support de la construction de tcltk widgets.

English version

R-widgetTools-1.12.0-2

This package contains tools to support the construction of tcltk widgets.

Official website

R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.noarch.rpm

R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.src.rpm

R-widgetTools.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-widgetTools/R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.noarch.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-widgetTools-1.12.0

Par pingou (Le blog de pingou) le jeudi, mai 24 2007, 20:01

rpm.pngR-widgetTools-1.12.0-2 - Tools to support the construction of tcltk widgets

R-widgetTools-1.12.0-2 - Outils de support de construction de tcltk widgets

French version

R-widgetTools-1.12.0-2

Ce paquet contiens des outils de support de la construction de tcltk widgets.

English version

R-widgetTools-1.12.0-2

This package contains tools to support the construction of tcltk widgets.

Official website

R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.noarch.rpm

R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.src.rpm

R-widgetTools.spec

To set up

su --login -c 'rpm -Uvh http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-widgetTools/R-widgetTools-1.12.0-2.fc6.noarch.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 

mardi, mai 15 2007

 
 

R-multtest

Par pingou (Le blog de pingou) le mardi, mai 15 2007, 23:00

Resampling-based multiple hypothesis testing

Calcul de multiples hypothèses basé sur une méthode de réechantillonage

French version

Calcul de multiples hypothèses basé sur une méthode de réechantillonage

Permet notamment de faire des calculs de FDR, FWER, TPPFP ainsi que des calculs de variabilité. Les résultats sont exprimé en terme de p-value.

Cette bibliothèque est utilisable pour identifier les gènes exprimés de façon significativement différentes dans les analyses de puces à ADN.

English version

Resampling-based multiple hypothesis testing

Non-parametric bootstrap and permutation resampling-based multiple testing procedures for controlling the family-wise error rate (FWER), generalized family-wise error rate (gFWER), tail probability of the proportion of false positives (TPPFP), and false discovery rate (FDR). Single-step and step-wise methods are implemented. Tests based on a variety of t- and F-statistics (including t-statistics based on regression parameters from linear and survival models) are included. Results are reported in terms of adjusted p-values, confindence regions and test statistic cutoffs. The procedures are directly applicable to identifying differentially expressed genes in DNA microarray experiments.

Official website

R-multtest-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm

R-multtest-1.14.0-0.1.fc6.src.rpm

R-multtest.spec

To set up

su --login -c 'wget http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-multtest/R-multtest-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm && rpm -Uvh R-multtest-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-maanova

Par pingou (Le blog de pingou) le mardi, mai 15 2007, 22:43

Tools for analyzing Micro Array experiments

Outils d'analyse de puce à ADN.

French version

Outils d'analyse de puce à ADN

Analyse de puce à ADN à plusieurs marqueurs utilisant différents modèles. Il permet de faire des analyses de variances par permutation, du clustering, et des arbres (réseaux).

English version

Tools for analyzing Micro Array experiments

Analysis of N-dye Micro Array experiment using mixed model effect. Containing anlysis of variance, permutation and bootstrap, cluster and consensus tree.

Official website

R-maanova-1.4.0-0.6.fc6.i386.rpm

R-maanova-1.4.0-0.6.fc6.src.rpm

R-maanova.spec

To set up

su --login -c 'wget http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-maanova-1.4/R-maanova-1.4.0-0.6.fc6.i386.rpm && rpm -Uvh R-maanova-1.4.0-0.6.fc6.i386.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou

 
 
 
 

R-Biobase

Par pingou (Le blog de pingou) le mardi, mai 15 2007, 22:00

Biobase: Base functions for bioconductor.org

Biobase : Fonction de base pour les bibliothèques de bioconductor.org

French version

Biobase : Fonction de base pour les bibliothèques de bioconductor.org

Fonctions requises par de nombreuses bibliothèque ou qui se substituent à des fonctions R.

English version

Biobase: Base functions for Bioconductor

Functions that are needed by many other packages or which replace R functions.

Official website

R-Biobase-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm

R-Biobase-1.14.0-0.1.fc6.src.rpm

R-Biobase.spec

To set up

su --login -c 'wget http://pingoured.dyndns.org/public/RPM/R-Biobase-1.14/R-Biobase-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm && rpm -Uvh R-Biobase-1.14.0-0.1.fc6.i386.rpm'

Billet original sur Le blog de pingou